L'attività della fosfatasi alcalina viene misurata per la diagnosi, il monitoraggio e il controllo della terapia di malattie epatiche, ossee, paratiroidee e intestinali. Le condizioni con aumento dei livelli di fosfatasi alcalina sono malattie epatobiliari, malattie ossee primarie e secondarie. Livelli ridotti di fosfatasi alcalina si riscontrano nell'ipofosfatasia familiare, nella malattia ossea adinamica nei pazienti in dialisi, nell'ipoparatiroidismo, nell'acondroplasia, nel nanismo ipofisario, nella malattia da radiazioni croniche e nella malnutrizione. Test del colore enzimatico per la determinazione quantitativa della fosfatasi alcalina nel siero umano e nel plasma eparinato.